定エネルギーの分子動力学

キーワード「MD.Type」を「NVE」と指定することで、定エネルギーの分子動力学シミュレーションが実行可能です。

    MD.Type          NVE       # NOMD|Opt|NVE|NVT_VS|NVT_VS2|NVT_NH

MDの各ステップで計算される数値は、出力ファイル「System.Name.ene」（System.Nameは「System.Name」を意味します） に記録されます。詳細は、「source」ディレクトリ内のファイル「iterout.c」に書かれていますが、いくつかの数値に関して、ここにも示しておきます。

         1:    MD step
         2:    MD time (fs)
        14:    kinetic energy of nuclear motion, Ukc (Hartree)  
        15:    DFT total energy, Utot (Hartree)  
        16:    Utot + Ukc (Hartree)  
        17:    Fermi energy (Hartree)

出力ファイル「System.Name.ene」中で、最初の列はMD Step（MDステップ）、2番目の列はMD time（MD時間）等に対応しています。