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定エネルギーの分子動力学

キーワード「MD.Type」を「NVE」と指定することで、定エネルギーの分子動力学シミュレーションが実行可能です。
    MD.Type          NVE       # NOMD|Opt|NVE|NVT_VS|NVT_VS2|NVT_NH
MDの各ステップで計算される数値は、出力ファイル「*.ene」(*は「System.Name」を意味します)に記録されます。詳細は、「source」ディレクトリ内のファイル「iterout.c」に書かれていますが、いくつかの数値に関して、ここにも示しておきます。
         1:    MD step
         2:    MD time (fs)
        14:    kinetic energy of nuclear motion, Ukc (Hartree)  
        15:    DFT total energy, Utot (Hartree)  
        16:    Utot + Ukc (Hartree)  
        17:    Fermi energy (Hartree)
出力ファイル「*.ene」中で、最初の列はMD Step(MDステップ)、2番目の列はMD time(MD時間)等に対応しています。



t-ozaki 2013-12-23